Působí v oblasti zpracování věcných záměrů zákonů a prováděcích předpisů v oblasti vnitrozemské plavby, přípravy podkladů pro návrhy zákonů a zajištění jejich projednávání ve spolupráci s odborem legislativním.
Vyjadřuje se k žádostem o udělování koncesí pro provozování vodní dopravy.
Zabývá se problematikou koncepcí lodního parku, jeho obnovy a související problematiky.
Zabezpečuje činnost související s působností ministerstva dopravy jako odvolacího orgánu ve správních řízeních vedených prvoinstančním plavebním úřadem - Státní plavební správou.
Zajišťuje mnohostranné a dvoustranné mezinárodní vztahy v oblasti vnitrozemské plavby.
Působí v oblasti zajišťování státního dozoru v oblasti vnitrozemské plavby dle zákona č. 114/1995 Sb., o vnitrozemské plavbě, ve znění pozdějších předpisů v návaznosti na zákon č. 522/1991 Sb., o státní kontrole, ve znění pozdějších předpisů.
V rozsahu daných kompetencí územně hájí trasy stávajících dopravně významných vodních cest v předepsaných technických parametrech a výhledových tras dle Evropské dohody o hlavních vnitrozemských vodních cestách mezinárodního významu v rámci směrných částí územních plánů velkých územních celků.
S ohledem na problematiku plavebního provozu zajišťuje implementaci Říčních informačních služeb.
V působnosti odboru metodiky řídí Státní plavební správu, včetně schvalování investičních záměrů vlastních investic a spolupráce na rozpočtu tohoto plavebního úřadu.
Dále zajišťuje přípravu a realizaci programů a opatření s finanční účastí státu v oblasti provozování plavby a veřejných přístavů včetně zajišťování programové dotační podpory s provozováním vodní dopravy a přístavů a podpory modernizace plavidel.